Dette projekt vil undersøge potentialet i at integrere genomisk klassifikation af Epstein-Barr-virus i den rutinemæssige diagnostik for danske lymfompatienter.

Baggrund

Epstein-Barr-virus (EBV) er et af de mest udbredte virus globalt og infekterer over 90 % af alle mennesker, hvor det replikerer i immunceller (Cohen et al., 2000, PMID: 10944566). Selvom de fleste infektioner er latente, betragter WHO virusset som en primær årsag til flere pædiatriske og voksne kræftformer – særligt lymfomer (WHO Classification of Tumours, 5th Edition). På Afdeling for Genomisk Medicin, Rigshospitalet, udfører vi DNA-sekventering af blod- og tumorprøver fra lymfompatienter med henblik på at identificere arvelige dispositioner og understøtte behandlingsstrategier. Da EBV har et dobbeltstrenget DNA-genom, bør det kunne påvises i vores sekventeringsdata, når det er til stede.

Projektet vil undersøge mulighederne for at inkludere genomisk klassifikation af Epstein-Barr-virus i den rutinemæssige diagnostiske praksis for lymfompatienter. Tilgangen vil primært være teoretisk og omfatte litteraturstudier for at identificere virale genomiske karakteristika og varianter, der er forbundet med EBV-relaterede kræftformer. Resultaterne kan potentielt få betydning for prognose, diagnose og behandling af både børn og voksne med lymfomer i Danmark.

English version

The project may be performed in Danish or English

The Epstein-Barr virus (EBV) is one of the most widespread viruses across the globe, infecting over 90% of humans, where it replicates within immune cells (Cohen et al., 2000, PMID: 10944566). While most infections are latent, the virus is considered by the World Health Organisation as the primary cause for several paediatric and adult cancers: particularly lymphomas (WHO Classification of Tumours, 5th Edition). At the Department of Genomic Medicine, Rigshospitalet, we perform DNA sequencing of blood and tumour samples from lymphoma patients, with the aim of identifying heritable dispositions and guiding treatment strategies. As a virus with a double-stranded DNA genome, Epstein-Barr should be detectable, when present, in our sequencing data. This project will investigate the potential of including genomic classification of the Epstein-Barr virus into routine diagnostic practice for Lymphoma patients. The approach will primarily be theoretical, exploring the literature to identify viral genomic features and variants associated with EBV-related cancers. The results of this project have the potential to impact the prognosis, diagnosis, and treatment of paediatric and adult patients with lymphomas in Denmark.